Toxikologische Untersuchungen über Chitosan sind dünn gesät. Mäusen, denen 5% Chitosan gefüttert wurden, verging allmählich der Appetit, sie verloren Gewicht und wurden lethargisch. Da der gleiche Effekt bei einer Injektion von 5 mg (i.p.) auftrat, darf von toxischen Wirkungen ausgegangen werden. Die Tiere wurden lichtscheu, ausgezehrt, bekamen Ödeme am Ohr, ein struppiges Fell und um die Schnauze Haarausfall. Die Autopsie ergab Fibrinablagerungen in Milz und Herz, das intraperitoneale Fett fehlte fast völlig. Die Autoren fanden Hinweise darauf, daß der Verlust des Fettgewebes eine Folge von Entzündungen und Nekrosen ist. Chitosan im Futter verminderte zudem die Anzahl von Bifidobakterien und Lactobacillen im Darm. Resümee der Autoren: "Die Nebenwirkungen machen dieses Material ungeeignet für eine breite Palette medizinischer Anwendungen."